| 回次 | 年(年度) | 参加校数 | 出場校 | 結果 |
|---|---|---|---|---|
| 11 | 1934年 | 20 | 膳所中 | 2回戦(初戦) |
| 16 | 1939年 | 20 | 大津商 | 2回戦(初戦) |
| 22 | 1950年 | 16 | 彦根 | 1回戦 |
| 23 | 1951年 | 16 | 八幡 | 1回戦 |
| 25 | 1953年 | 19 | 彦根東 | 2回戦(初戦) |
| 28 | 1956年 | 20 | 大津東 | 2回戦(初戦) |
| 29 | 1957年 | 20 | 八幡商 | ベスト8 |
| 31 | 1959年 | 23 | 膳所 | 2回戦(初戦) |
| 34 | 1962年 | 23 | 八幡商 | ベスト8 |
| 35 | 1963年 | 28 | 大津商 | 1回戦 |
| 40 | 1968年 | 30 | 甲賀 | 1回戦 |
| 41 | 1969年 | 26 | 比叡山 | 2回戦(初戦) |
| 47 | 1975年 | 29 | 能登川 | 1回戦 |
| 49 | 1977年 | 30 | 伊香 | 1回戦 |
| 50 | 1978年 | 30 | 比叡山 | 1回戦 |
| 52 | 1980年 | 30 | 瀬田工 | 1回戦 |
| 53 | 1981年 | 30 | 比叡山 | 1回戦 |
| 54 | 1982年 | 30 | 瀬田工 | 1回戦 |
| 55 | 1983年 | 32 | 長浜北 | 1回戦 |
| 56 | 1984年 | 32 | 高島 | 1回戦 |
| 57 | 1985年 | 32 | 堅田 | 1回戦 |
| 59 | 1987年 | 32 | 伊香 | 1回戦 |
| 60 | 1988年 | 34 | 野洲 | 2回戦(初戦) |
| 61 | 1989年 | 32 | 八幡商 | 1回戦 |
| 65 | 1993年 | 34 | 八幡商 | ベスト8 |
| 66 | 1994年 | 32 | 石山 | 1回戦 |
| 68 | 1996年 | 32 | 比叡山 | 2回戦 |
| 70 | 1998年 | 36 | 近江 | 2回戦(初戦) |
| 71 | 1999年 | 32 | 比叡山 | 1回戦 |
| 75 | 2003年 | 34 | 近江 | ベスト8 |
| 76 | 2004年 | 32 | 八幡商 | 2回戦 |
| 77 | 2005年 | 32 | 八幡商 | 1回戦 |
| 78 | 2006年 | 32 | 北大津 | 2回戦 |
| 79 | 2007年 | 32 | 北大津 | 1回戦 |
| 80 | 2008年 | 36 | 北大津 | 3回戦 |
| 81 | 2009年 | 32 | 彦根東 | 1回戦 |
| 84 | 2012年 | 32 | 近江 | 2回戦 |
| 87 | 2015年 | 32 | 近江 | 2回戦 |
| 88 | 2016年 | 32 | 滋賀学園 | ベスト8 |
| 89 | 2017年 | 32 | 滋賀学園 | 2回戦 |
| 90 | 2018年 | 36 | 近江 | 3回戦 |
| 90 | 2018年 | 36 | 彦根東 | 3回戦 |
| 90 | 2018年 | 36 | 膳所 | 2回戦(初戦) |
| 94 | 2022年 | 32 | 近江 | 準優勝 |
滋賀県|選抜高等学校野球大会歴代出場校